Бухучёт медклиники: лицензия и НДС
2026-09-20 · Елена Любицкая
Когда медицинские услуги освобождены от НДС
Медицинские услуги не облагаются НДС, если клиника работает по лицензии и оказывает услуги из перечня, утверждённого постановлением Правительства № 132. В перечень входят диагностика, лечение, профилактика, реабилитация, санитарное просвещение — практически весь спектр медицинской помощи. Освобождение действует автоматически: вы не начисляете НДС при выставлении счёта пациенту и не подаёте декларацию по этим операциям.
Косметология попадает в перечень, только если она медицинская — например, лазерное удаление рубцов или лечение акне. Салонные процедуры (массаж для красоты, чистки лица без медицинских показаний) в перечень не входят — с них платите НДС на общих основаниях.
Отдельный учёт лицензионных и нелицензионных услуг
Если клиника одновременно лечит пациентов и продаёт косметику или оказывает немедицинские услуги, нужен раздельный учёт. Заведите два субсчета к счёту 90.01: один для лицензионных медуслуг (без НДС), второй для облагаемой деятельности (с НДС). Каждую операцию проводите на свой субсчёт — так вы сразу видите структуру выручки и можете подтвердить освобождение перед налоговой.
Входящий НДС по общим расходам (аренда, коммунальные услуги, зарплата администратора) делите пропорционально выручке. В конце квартала считаете долю каждого вида деятельности и распределяете суммы налога: часть принимаете к вычету, часть включаете в расходы. Если доля необлагаемых операций не превышает 5 % за квартал, можно весь входящий НДС принять к вычету — но этот порог нужно подтверждать расчётом в регистрах учёта.
НДС при совмещении медуслуг и розницы
Продажа товаров (БАДы, косметика, ортопедические изделия) облагается НДС, даже если клиника имеет медицинскую лицензию. Товары не входят в перечень освобождённых услуг по ст. 149 НК РФ. Заведите отдельный субсчёт к 90.01 для розничных продаж, начисляйте НДС в полном объёме и принимайте к вычету входящий налог по закупленным товарам.
Типичная ошибка — не делить входящий НДС по общехозяйственным расходам. Налоговая при проверке восстанавливает весь налог, принятый к вычету без распределения, начисляет пени и штраф. Чтобы избежать претензий, проверьте текущий порядок учёта — это можно сделать через бухгалтерское обслуживание с настройкой раздельного учёта под вашу структуру выручки.
Страховые взносы для врачей и медперсонала
Врачи и медсёстры в штате — обычные работники, с их зарплаты начисляете взносы по общим тарифам: 30 % в пределах лимита, 15,1 % сверх лимита (с 2025 года действует единый тариф взносов). Специальных льгот для медперсонала в частных клиниках нет.
Если врач работает по договору ГПХ (разовые консультации, дежурства), взносы начисляете без больничных и декретных — только на пенсионное и медицинское страхование. НДФЛ удерживаете в любом случае.
Документы для подтверждения льготы по НДС
Налоговая может запросить подтверждение освобождения от НДС — готовьте копию лицензии с приложением (перечень работ и услуг), договоры с пациентами, акты оказанных услуг, прайс-лист с расшифровкой, какие услуги лицензионные. Храните эти документы весь период действия освобождения плюс четыре года после — стандартный срок для выездных проверок.
Если меняете лицензию (добавляете новые виды услуг или открываете филиал), обновляйте копию в учётных регистрах — инспектор сверяет актуальность при камеральной проверке.
Частые ошибки в учёте медклиник
Первая ошибка — не ведут раздельный учёт при совмещении льготных и облагаемых операций. Налоговая доначисляет НДС на всю выручку, если не видит чёткого разделения.
Вторая — оформляют немедицинские услуги (SPA, фитнес, салонный массаж) как медицинские и не платят НДС. Инспекция переквалифицирует операции и начисляет налог задним числом.
Третья — забывают актуализировать лицензию при изменении адреса или состава учредителей. Формально освобождение от НДС действует только при наличии действующей лицензии — если её приостановили или аннулировали, льгота пропадает с даты решения Росздравнадзора.
Нужна помощь с настройкой раздельного учёта или проверкой документов для налоговой — оставьте заявку через форму на сайте, по телефону или в Telegram. Разберём вашу ситуацию и покажем, как избежать претензий от ФНС.
Часто задаваемые вопросы
Нужно ли платить НДС с медицинских услуг по лицензии?
Нет, если услуга входит в перечень из постановления Правительства № 132 и у клиники есть действующая лицензия. Освобождение действует автоматически — декларировать НДС по таким операциям не нужно.
Как вести раздельный учёт, если клиника продаёт косметику?
Заведите отдельные субсчета к счёту 90: один для лицензионных медуслуг (без НДС), второй для розницы (с НДС). Входящий НДС по общим расходам делите пропорционально выручке — ежеквартально считаете долю каждого вида деятельности и распределяете суммы налога.
Частые вопросы
Нужно ли платить НДС с медицинских услуг по лицензии? Нет, если услуга входит в перечень из постановления Правительства № 132 и у клиники есть действующая лицензия. Освобождение действует автоматически — декларировать НДС по таким операциям не нужно.
Как вести раздельный учёт, если клиника продаёт косметику? Заведите отдельные субсчета к счёту 90: один для лицензионных медуслуг (без НДС), второй для розницы (с НДС). Входящий НДС по общим расходам делите пропорционально выручке — ежеквартально считаете долю каждого вида деятельности и распределяете суммы налога.